D6 در عملکرد AF با ایجاد تحسین بالاتر از سیستم AF بسیار تحسین شده مدل قبلی خود ، D5 ، زمینه جدیدی را ایجاد می کند. یک سیستم AF AF با سنسور متقاطع با تراکم بالا ، 105 نقطه کاملاً قابل انتخاب ، به عکاسان اجازه می دهد تا فوکوس را بدون ترکیب مجدد تقریباً در هر کجا تنظیم کنند. یک طرح فوکوس از نو تصور شده ، مناطق با حساسیت فوکوس خودکار را با آرایش حسگر سه گانه برای هر نقطه فوکوس منفرد کاهش می دهد و در نتیجه 1.6 برابر پوشش فوکوس بیشتر x ، حتی با سوژه های متحرک در حالت های عکسبرداری با سرعت بالا است.